一、存在的问题
(一)选题把握不准
选题是确定毕业论文研究的方向，是毕业论文写作的第一步。即使教学学院给提供了一些参考选题，但学生在选题时仍有不少问题。主要表现在：一是追求热点，对药品现代物流、医药卫生体制改革、公立医院改革、药妆等兴趣浓厚，选此类热点课题的多，能够创新的少;二是游离在所学专业或毕业实习之外，如在苏州礼来公司实习的医药贸易专业学生选题是“当前我国经济形势下的公路建设与发展”，在药品经营企业仓库实习的学生选题是“税收政策与促进就业的思考”，在山东步长制药实习的学生选题是“目前我国发展保障性住房的政策分析”等;三是理论性太强，选题难度太大，超出了本科生能够把握的范围，如在药品检验所实习的同学选题是“药品供应保障体系构建研究”。
(二)拼凑现象严重
学生通过网络查找资料比较普遍，网络给学生带来便捷的同时，也打开了惰性的方便之门。直接从网络上下载他人的文章当然是严令禁止的，但拼凑却是屡禁不止。一是拼凑法，从网络上下载几篇同类型的论文，通过剪接拼凑成一篇论文，往往结构混乱，内容不完整，甚至自相矛盾;二是雷同法，几个同学的论文题目略有差异但内容雷同，甚至仅是顺序安排上略有差异;三是穿越法，为通过文献检索方法核查，把不同专业师兄师姐或不同年度的毕业论文，稍作修改或拼凑，没有创新。
(三)文献使用不规范
毕业论文写作要求本科生学会检索和使用参考文献，但难如人意。一是在正文中不注明资料来源，特别是数据资料，对从互联网取得的资料往往不注明网址;二是不了解参考文献标注的格式，同一篇论文中标注方式各不相同，不了解对报纸、网站、会议的标注格式;三是不熟悉参考资料引用的要求，出现正文标注的与文后的参考文献无对应;四是引用文献过于陈旧;五是引用文献过长，甚至涉嫌抄袭。
(四)行文不严谨
毕业论文写作要求本科生展现科研论文的写作能力，有时差强人意。一是思路不清晰，缺乏基本学术论文写作训练;二是基本概念解释不清楚，下定义的能力不够;三是凑字数，为达到毕业论文字数要求，可有可无的材料大量引用，如“某某药品的市场营销策略”，在绪论中把该种药品的说明书一字不落地抄下来;四是文章内容前后关联性不强，在原因分析、对策建议等方面，没有针对存在的问题进行分析。
(五)摘要撰写混乱
毕业论文摘要撰写混乱主要表现有：一是没掌握毕业论文摘要撰写规则，目的不明确，方法交待不清，结果、结论模糊;二是摘要内容与正文关联性不强。特别是正文在导师指导后有了重大修改，在摘要里没有体现;三是英文摘要质量不高，有的甚至从网络上下载翻译软件“写作”英文摘要，以致出现语病、笑话也就不足为奇了。
(六)格式不规范
论文格式是毕业论文外在形式，但学生上交的毕业论文，格式五花八门。一是标题序号不一致，多种序号混用;二是图表不编号或编号混乱，甚至为扫描或截图;三是数据不一致，使用不同的单位;四是全角、半角混用等。
二、对策
(一)提高对毕业论文重要性的认识
本科毕业论文是大学生本科阶段学习成果的全面总结，是对学生创新能力的考查，是实现高等教育培养目标的重要教学环节，是一所高校整体教学质量的直接反映。教学学院要高度重视，在教学安排，指导教师遴选，建立、完善毕业论文评价体系等方面多做工作，形成工作制度;指导教师要重视对学生的业务指导，重点抓好论文选题、研究方案、文献检索等;毕业生要高度重视，处理好毕业论文写作与完成实习工作的关系，主动与指导教师沟通，认真撰写，反复修改，展现研究性学习和实践性学习的成果。
(二)引导学生与指导教师的双向选择
指导教师对学生科研能力提高影响大，一是指导和训练学生毕业论文写作，训练文献检索、方案编写等;二是审查学生论文的规范性、真实性，审查参考文献、论文格式、英文摘要等的规范性;三是把握学生毕业论文合格性，凡没有指导教师签字同意参加论文答辩的学生一律不能参加答辩。学生与指导教师双向选择，有利于提高指导效果。教师有自己的研究领域，在导师双选前，要公示指导教师的学识特长，方便学生选择指导教师，指导教师根据学生的论文选题方向选择学生。
(三)明确毕业论文质量标准
编制好学生毕业论文质量标准，一是明确学生论文格式基本规范，制定统一的格式标准;二是明确参考文献的时效性，一般以近三年内的资料为好;三是适当放宽对毕业论文字数的要求，对本科生以不少于5000字为宜，要求学生观点表达清楚、问题分析透彻，结构完整，避免为凑字数而将无关紧要的内容大量地放入论文中，致使主题被淡化。
(四)设立学生科研课题
毕业论文应依托科研课题，一方面学生参与指导教师的课题，或者参加实习单位的科研，提高科研意识和科研水平，有利于写出高水平的毕业论文;一方面针对本科生参加科研课题机会少的困难，设立若干学生科研专项，结合实习岗位，确定与企业关联度高的选题，组织毕业生分组中报，以毕业论文为结题成果。立项课题以解决现实存在问题作为出发点和落脚点，对学生和指导教师都有一定的压力，也保证了论文的创新性。有了科研课题的依托，学生的科研积极性得到激发，资料收集、整理和研究能力得到锻炼，为毕业论文的写作积累研究方法、研究经验和奠定选题的方向，有利于提升毕业论文的质量。
(五)强化学术道德教育
必须独立完成毕业论文，规范引用参考文献，防止抄袭、剽窃他人学术成果。加强毕业生学术道德教育非常必要，一方面要将学术道德教育与学生的日常行为教育、大学生思想政治教育结合起来，与大学生就业教育、职业道德教育结合起来，另一方面对出现有违学术道德的，坚决不允许参加答辩或取消其答辩资格。引入论文检索比较相关软件，杜绝违背学术道德的行为。
(六)认真组织评阅答辩
在论文评阅和答辩时，指导教师都希望自己指导的学生能一次通过，担心影响教学评价结果;学生更希望自己的论文能一次性通过，否则会影响自己的毕业。毕业论文评阅是重要环节，评阅分组的关键是将指导教师与学生毕业论文按选题分类，采取分类评阅的办法，避免评阅中出现不公平。答辩是对毕业论文质量把关的最后一个重要环节，重点是防止形式化。在组织答辩活动中，要确定答辩组，实行组长负责制，采取答辩前确定重点提问教师，避免出现走过场的现象。