医学博士论文：医学开放存取资源的分布与获取途径 由硕士毕业论文中心，硕士论文组整理提供，本文阐述了医学开放存取资源的分布与获取途径
1 开放存取资源概述
开放存取（ Open Access, 简称OA） , 又被译为公开获取、公开访问、开放使用等。根据目前国际上关于OA 较权威的三大宣言 布达佩斯开放存取倡议[ 1] 、 巴斯达开放存取出版声明[ 2] 以及 柏林宣言[ 3] 对于OA 的定义， 笔者认为开放存取资源（ OpenAccess Resource, 简称OA 资源） 是作者或出版社在拥有版权和授权的情况下， 将其发表或出版的科研成果通过OA 形式在互联网上进行发布， 并以OA 形式提供给公众的一种开放性学术资源。
作为一种在网络环境中发展起来的新型学术交流机制和全新的学术信息出版模式， OA 资源的宗旨在于打通学术交流空间以及使用权限上的障碍， 利用网络条件促进学术资源的传播和交流， 实现科学成果的广泛共享， 提高科学研究的效率以及提升科学研究成果的公共利用率， 受到了学术界、出版界和图书情报界广泛的认同和支持。
随着OA 运动的不断发展， 近年来， OA 资源迅速增长， 数量可观。当前OA 资源主要有OA 期刊和OA 仓储两种形式[ 4] , 根据已有研究成果显示， 著名期刊指南 乌利希国际期刊指南所收录的OA 期刊中，生物学、医学的数量最多[ 5] 。在全球最大的开放存取仓储目录OpenDOAR 统计的OA 仓储学科分布上，医学仓储数量位居第一， 已达122 个[ 6] 。在质量控制方面， 大部分OA 期刊要求提交的论文必须经由同行评审或者有编辑进行质量控制， 一些著名的OA 出版社出版的OA 期刊大多都被SCI 索引， 其影响因子还居于所属学科前列[ 7] 。因此， 医学类OA 资源的数量多， 质量也相对有保障， 笔者将常用的医学OA 资源的获取归纳为OA 资源出版机构、学科库以及OA 期刊目录三种途径， 供广大医学工作者参考。
2 OA 资源出版机构
OA 运动的兴起带动了一批OA 资源出版机构的发展， 在医学方面以PLoS、BioMed Cent ral 和Hig hWire Press 最有影响力。这些出版社出版的OA 期刊不仅在学术质量上有保证， 也利于用户收集利用。
2. 1 PLoS公共科学图书馆（ Public Library of Science, 简称PLoS） （ 网址： ht tp: / / ww w. plos. or g/ ） 是一个由科学家和医生组成的非营利机构， 致力于把世界上科学和医学的文献作为免费资源向公众开放。
目前， 已出版7 种经过同行评审的生命科学和医学领域的OA 期刊， 分别是： PLo S Biolog y、PLoSMedicine、PLoS Computat io nal Bio logy 、PLo S Genetics、PLoS Pathog ens、PLoS ONE、PLoS N eg lectedT ropical Diseases, 它们均被SCI[ 8] 和MEDLINE[ 9] 收录。以上七种期刊可在PLoS 网站上免费获取全文。
其中PLoS Biolo gy、PLoS Medicine 是PLoS 第一档次的期刊， 实行非常严格的同行评审制度， 退稿率达到90% 以上。PLoS Biolog y 更是被定位为生物医学领域的高端期刊， 希望赶超Science、Nature 和Cell三大传统生物医学领域权威期刊， 该刊自2003 年出版以来影响因子一直居于生物学期刊榜首且远远高于本学科其他期刊， 五年平均影响因子达14. 798[ 10] 。
PLoS Medicine 也表现不俗， 五年平均影响因子为14. 023, 在其所属学科MEDICINE、GENERA L &INT ERNAL 2009 年期刊影响因子排名中位居第六[ 11] 。PLoS ONE 定位为发表任何在方法学上合理的文章， 采用 轻度#同行评审（ lig htpeerview ed） 的评审机制， 投稿相对容易。
2. 2 BioMed Central生物医学中心（ BioMed Centr al ） （ 网址： ht tp: / /w w w. biomedcent ral. com/ ） 是一家提供经过同行评审的生物学、医学研究论文开放出版的独立出版社。
BioMed Cent ral 对论文的质量进行严格控制， 对所有提交的研究论文进行严格的同行评议， 并且要求评审人员在每篇论文后面署名， 论文的初稿、评审人员的意见、修改稿等都发布在网站上。BioMed Cent ral 除了将其出版的所有论文全部及时存入PubMedCentr al 学科库和多个其他国际资源库， 如Goog le、Goog le Scho lar 、OAIster、Scirus、So cdar 和Zeto c 中外， 还允许作者立即将已发表文章的最终正式版存入任何适当的数字资源库， 因此， 用户可以通过多种途径获取BioMed 出版的OA 期刊。此外， BioMed Cent ral 所有杂志的论文都采用Scopus 和Go ogle Scholar进行跟踪， 以便作者们查看自己的研究被引用的次数[ 12] 。
截至2010 年9 月9 日， BioMed 提供了206 种经过同行评审的生物医学研究方面的期刊[ 13] , 其中有99 种期刊被SCI 索引[ 14] , 这说明该出版社出版的期刊中已有48% 的期刊被ISI 索引， BioMed Cent ral 已成为出版高质量的OA 期刊的重要力量。但与PLo S相比， BioMed Cent ral 发行的OA 期刊数量多， 但影响力略低。
2. 3 HighWire PressHighWire Pr ess （ 网址： ht tp: / / hig hw ir e. stanford. edu） 是全球最大的提供免费全文的学术文献出版商之一， 于1995 年由美国斯坦福大学图书馆创立。
最初仅出版著名的周刊。ournal o f Biolog ical Chemist ry#, 目前已收录电子期刊1 236 种， 内容覆盖生命科学、医学、物理学、社会科学， 其中以生物医学方面的OA 期刊论文居多。
HighWire Press 的出版物中不乏一些影响力比较高的期刊， 如Journal of Biolog ical Chemist ry、Health Policy and Planning、Health Ser vices Research and Policy 、Jo urnal o f Infect ion Pr ev ent io n、Jour nal of Public Health 和Occupat ion and Enviro nmental Medicine。在所收录的期刊中， 46 种完全免费， 如Journal o f Cl inical Invest igat ion、CA: A CancerJour nal for Clinicians、Clinical Diabetes; 282 种免费提供部分过刊全文、即在期刊出版一定时间（ 6~ 18 个月） 后免费开放， 如American Journal of Clinical Nut rit io n、A merican Journal of Physio logy 和Blood等[ 15] 。目前共有1 987 039 篇可免费获得的全文[ 16] 。
HighWire Press 界面友好， 检索功能丰富， 可以通过浏览主题词来检索对应的期刊， 同时也提供了一些个性化推送服务和研究工具， 如引文管理软件、桌面关键词、地图等[ 17] 。因此， 笔者认为该网站是生物医学领域研究者较好的信息参考来源。
3 医学学科库
学科库， 也被称为学科知识库#、学科开放存取仓储#或学科仓储#, 在国外通常被称为disciplinaryarchives#、subject （ discipline） based repositories#、? subject specif ic reposito ries #、disciplineo rientedr epositor ies#和domain specif ic data ar chives#等。有学者认为学科库#最能代表这个主题概念[ 18] , 笔者亦赞同这一观点。
关于学科库的准确定义尚无明确标准， 笔者认为，从学科库建设角度来说， 它是以学科为主线， 对某个学科领域的各种类型的资源进行捕获、收集、整理、描述、组织、索引， 实现这些对象的长期保存和广泛传播， 以实现对这些对象资源的共享和利用为目的的知识库。
用户可访问全球最大的开放存取仓储目录OpenDOAR 通过学科浏览功能方便找到医学仓储库。前文中已说明在目前的OA 仓储学科分布上， 医学仓储数量最多， 无法详细列举， 在此仅介绍最著名的医学学科库公共医学中心（ PubMed Centr al, 简称PMC） 。
PMC 创建于2000 年2 月， 是一个数字化的全文数据库， 由美国国家医学图书馆（ Nat ional Library of Medicine, 简称N LM） 下的生物技术信息国家中心[ 美国国家生物技术信息中心（ Nat ional Center fo r Biotechnolog y Informat ion） , 简称NCBI] 开发、管理和维护。
学科领域涉及生物医学、行为科学和临床研究等学科领域， 提供完全免费的全文服务。PMC 目前已收录1 062种期刊， 另外， 还提供MEDLINE、PREMEDLINE 的文摘信息。出版社自愿加入PMC, 但加入的期刊必须满足编辑出版标准， PMC 论文的版权属于期刊或作者所有[ 19] 。
在资源开放程度上， 由于PMC 中的论文大多有版权限制， 因此全文开放存取的时间有所差异， 分为可立即获取（ Immediate）、1 个月后（ After 1 month） 、3个月后（ Af ter 3 mo nths） 、4 个月后（ Af ter 4 months） 、5 个月后（ A fter 5 months ） 、6 个月后（ After 6months）、12 个月后（ Af ter 12 months） 和36 个月后（ After 36 months） 开放存取几种形式， 但83. 6% 的全文都是可以立即获取的。PMC 的资源获取仅仅在获取时间这一个方面有所限制。
在资源质量控制方面， PMC 收录的期刊论文均经过同行评议， 质量非常高， 它收录的很多期刊都被SCI所收录。2009 年3 月11 日， 美国总统奥巴马签署了2009 年综合拨款法案（ T he 2009 Consolidated Appropriations Act ） , 其中包括使美国国家卫生研究院（ Nat ional Institutes of Health, NIH） 的强制性实施的公共存取政策（ Public Access Policy） 永久生效[ 20] 。该政策要求受NIH 资助开展研究而产出的经同行评审的最终版本论文全文在期刊发表后至多12 个月内均应通过PMC 提供免费在线利用与检索。这一法案为PMC 的资源数量和质量提供了政策上的根本保障。
PMC 的成立和发展是一批有志于推动学术论文自由出版的科学家共同努力的结果， 成为目前生物医学研究者一站式获取资源的理想站点。
4 OA 期刊目录
除了专门的医学OA 资源出版机构、医学学科库之外， 综合性的OA 期刊目录也是获取医学OA 期刊的途径之一。目前， 不少机构和研究人员对现有的OA 期刊进行了收集整理， 并提供站点和强大的检索功能， 有的甚至提供了期刊内论文级别的检索功能。
笔者将其中最有影响的站点整理如下（ 表中数据均于2010 年9 月9 日更新） 。见表1。
以下5 个站点可以说是目前世界上收录范围最广、影响力最大的OA 期刊目录网站， 具有发展迅速、资源数量庞大的特点， 并都提供较为健全和方便的检索和浏览功能以及实用而有特色的增值服务， 限于篇幅不再展开。
除了以上这3 种医学OA 资源直接的来源渠道之外， 还可以通过一些专业OA 资源的搜索引擎， 如OAIster、ePrintsU K 来查找OA 资源， 这些搜索引擎对遵守OAIPMH 协议的OA 资源进行搜索， 其中也能找出有关OA 期刊的信息， 并提供全文检索服务。
5 结语
总之， OA 期刊对降低科学文化传播的成本， 促进科学信息的广泛传播、加快学术信息的交流、保障科学信息的长期保存， 达到文献资源的免费共享， 具有深远的进步意义。随着资源共享理念得到越来越多的政府机构、学术团体以及出版商的认同， OA 资源在质量和数量上都有质的飞跃， 希望广大医学工作者能关注、利用OA 资源并最终成为OA 运动的参与者。
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