在职工程硕士论文的写作主要分为选题、文献检索、开题、研究与写作、检查、答辩、修改七个阶段（如图1），下面我们就这七个阶段详细分析。
图1在职工程硕士论文写作流程
１．选题一篇工程硕士专业学位论文主要围绕一个问题展开研究，首先要有对问题的陈述，或者叫选题，选题要求有科学意义和研究价值。首先需要说明选题背景、题目来源；然后是对问题的描述，说明研究一个什么样的问题；为了使论文写作顺利完成，需要学生说明对此问题的研究兴趣、自己已经具备的专业知识和特长以及所具备的基础条件，比如参与过的研究项目等。
选题是保证专业学位论文质量的最重要环节。确定研究问题，尤其是值得研究的科学问题是专业学位论文写作的第一步。一般要求学生根据自己的工作经经济效益和社会效益。选题除有意义、有价值之外，还要注意与学生本人的工作经历以及兴趣爱好和专长结合起来，选题如果是论文作者自己熟悉和感兴趣的内容，研究起来就能得心应手，挥洒自如，快乐无比。
衡量选题好坏的标准是看其是否具有研究价值和能够取得的研究成果。比如，有一位工业工程工程硕士候选人选择“基于多品牌、多产品的营销组织结构模式研究”作为工程硕士专业学位论文题目，其中有一个风险，那就是作者假设营销组织结构与营销绩效正相关，其实，营销绩效除了与营销组织结构相关外，还与很多因素有关，因此研究结果可能会有片面性；再比如，选择“高校食堂社会化”作为研究题目，国外高校的食堂基本上是社会化的，国内为什么行不通？这里会涉及到许多复杂的问题和关系，研究可能得不出有效的结论或者无法验证所阐述的论点的正确性。
２．文献检索
题目确定之后，就需要进行文献检索，以了解该问题的研究现状，目前已经达到的研究水平和阶段，还有什么问题没有解决，这是专业学位论文研究的基础，即选题的依据，需要通过文献检索与阅读来获取研究现状信息。文献检索的目的是：（１）验证选题是否有意义；（２）了解该题目的国内外研究现状和水平；（３）确定题目是否可以继续研究下去；（４）为题目研究提供指南。
３．开题
经过选题、文献检索之后，确定题目可以继续做下去，就可以撰写开题报告、准备开题了。开题报告除了论述选题的目的、意义、研究现状、研究成果评述之外，还包括研究计划，如研究目标、研究内容（拟解决的关键问题）、研究方法、实验设计和可行性分析、进度计划、质量保证措施以及预期的研究成果和可能的创新点，初步的论文写作提纲等。开题报告完成之后，需要向由指导教师组成的导师组（包括企业导师）进行汇报，征求导师组的意见，通过之后，才算完成开题。
开题通过开题报告会的形式进行，学生通过文献检索对所研究的问题得出初步的解决方案，完成开题报告即可进行开题报告会。开题报告会一般由导师主持，３位以上的导师（包括企业导师）参加。学生需要汇报开题报告的内容，接受导师的提问。通过开题报告会，学生对所研究的问题会有更加清晰的认识，解决思路更加明确。通过开题的学生可以继续论文的研究；没有通过开题的学生需要重新思考选题或者解决方案。
４．研究与论文写作
论文的写作过程其实应该是一个研究过程，将研究的结果整理出来，按规范的格式写作，就形成了论文。因此，这一阶段是论文写作的关键，也是花费时间最长的阶段。一般而言，在这一阶段，重点不是写作而是研究。具体包括对问题的详细描述，可能的解决方案，尝试最经济、有效的方案，实验或实践这一方案，取得什么样的效果，还存在什么问题未能解决，对研究过程进行总结等。这其中或许会有许多反复，也可能会走弯路。只有经过这一历程，研究成果才具有价值。最后，把研究过程按照某种逻辑和思路描述出来，就形成了论文。
学生在研究过程中，一定会遇到许多困难和问题，这就需要导师的悉心指导。一般要求学生定期与导师见面，学生向导师汇报研究进展，研究中遇到的困难和问题，然后导师进行针对性指导，以拓展学生的思路，破解研究中的难题。每次与学生见面，需要记录见面的时间和地点、讨论的问题及解决方案，以形成检查报告。
５．检查
在论文的写作过程中，学生会遇到预想不到的问题和困难，有时甚至导致论文无法写下去。因此，要保持与导师的沟通与交流，即定期与导师会晤，汇报论文的研究进展。发现问题及时与导师沟通，导师会根据自己的知识与经验加以点拨，学生会顿开茅塞，恍然大悟，问题也迎刃而解。有时还需要根据具体问题，调整研究或解决方案，并重新进行可行性分析，进而调整研究计划。导师可以通过这一过程了解学生的研究进展，发现学生的研究能力，并根据学生的不同特点，帮助学生提高研究水平和写作能力。
６．答辩
论文初稿完成之后，经过导师的审阅，提出修改意见，学生修改再经过导师审查合格之后，就可以准备论文答辩了。答辩是论文写作的最后一个环节，它考查论文的规范性和学生的口头表达能力，判断论文的贡献（研究成果），同时，通过回答问题还能判断学生对论文研究涉及到的相关知识和问题的领悟能力。经过答辩委员会讨论，答辩结论包括通过、修改和不通过三种。
７．修改
一般而言，答辩通过之后，论文都需要修改。修改分小改与大改。答辩委员会会明确告诉学生论文需要修改的内容，学生修改之后，需要做一个修改说明，详细描述已经修改的内容。修改完成之后，需要经导师审查，通过之后再由答辩委员会批准。